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浅析sklearn中的数据预处理方法

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{0 S5 L8 q# {

简介

3 F0 t! [( S. D5 z; X- Q/ a

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

; A' p! c8 i& E$ |+ ^

数据集准备

% B4 w% V' V& o" C$ n* A4 M

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

2 o/ n& G5 k4 ^3 L5 Q' y
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集/ h0 `1 G8 |& |0 v6 }4 A* @ import numpy as np : s. G1 z g: }) W% l% X d& `. ~! U! E% X3 z( V, j iris = load_iris() # 特征矩阵 4 _( Z: k, G4 M6 J& H# x print(iris.data.shape) # (150, 4) % R0 W7 N2 U. b" | u D print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] / s7 y. A n2 J1 n1 P8 K print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]. Y/ h6 Q1 `8 W# Y: o8 P
# L- o: E! A0 M; _

无量纲化

& N. p* }* N L4 G. F$ U

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

/ w3 j8 A/ a2 S( `$ h' Q

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

* C* J$ l2 Q" R5 C# t

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

3 Z) _5 s T& ?+ z) O

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

$ l1 V" N/ q" T8 d& l1 H! c5 F+ ?- K

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

8 j1 G6 `1 q0 E+ v. D+ W# L

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

0 \# `8 X' P: G# b

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

; U' q& v4 A( _7 s; J

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

) ^1 e7 x* |, a7 j* R

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

1 |6 T! E8 f8 s& ^ G

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

( v& `7 v+ W! i" r( E. A. R6 z

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

5 K6 Q( A% n! j3 h6 Q. C

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

+ O) W, S) D; S' G" j1 D
from sklearn.preprocessing import StandardScaler ( Y) |/ A7 v+ h( x # r$ p4 ] i9 k$ y, h # 标准化,返回值为标准化后的数据+ z: z4 q7 g9 {, {: z standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data)! T/ O$ N5 m0 I# K: R print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]) K4 s. b) j' s" Z7 a+ }
8 z# N9 [0 P& r D' B/ i* V$ {

归一化-区间缩放法

" ^- c" [: A; J# z: k6 t# p

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

$ e6 i- e: v4 j5 l" v5 h6 k% |

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

9 U( e) v: K) y& p. H1 P6 K# u

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

5 S4 U" w" X. K2 l4 m! o5 d$ i

常见用于神经网络。

6 G$ b/ v+ K7 U% o# x' L

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

3 l r `$ t5 t
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 4 N m3 t; E( P# H; Q4 C5 { from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler ^' h9 W2 q, M7 i# t " G5 L' I7 E* Z; u min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) $ j2 a( u0 l$ ?0 A print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]5 o* Q7 X, e4 g
1 L# Q; }" Y- H" `) ]/ v2 b- M

正则化(Normalization)

! P" l. l0 y9 Y9 c- y+ E" Z

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

1 I$ S8 n9 R3 M5 C& H

常见用于文本分类和聚类。

" F/ E$ g( g- W

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

/ i% W8 M: X4 Q/ A# n7 o

LpL_p范数的计算公式如下所示:

4 D, ^& ^# N% Q3 [, Q' D/ r

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

/ k. J9 G; A0 o

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

# m! Y3 J/ f4 m# T* L3 S O

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

b" O5 S, |+ X2 f* ^7 A" n

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

3 u9 p" X/ |& S5 {

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

# n3 `7 i H2 ^0 V
from sklearn.preprocessing import Normalizer * X; A" X& ]' N: b: P0 R' _! r! J6 O4 d; { norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) / m5 g+ | L9 x. q print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]+ s! B1 I, [0 I3 s5 s
7 x: f' M' I) H8 Q( O8 }1 P% E

参数说明:

+ I( U$ Z8 N \- \6 ^

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

& f/ l& q) B% o

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

% o$ D9 y; `$ v7 L- G

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

9 m% D* w, \$ V& v: ^% u; U

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

* S2 U) x! T9 U7 q! h4 c

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

7 [& p, V) F& e
from sklearn.preprocessing import Binarizer! R5 |5 @" C! M5 c7 m/ j+ ? 7 D3 w4 N7 g) Z- |3 S3 K0 }" t- C3 f # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 : W; p# M% a3 |& \/ ~ binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)) V K' h. E$ w1 S2 M% t print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] , G% T7 ]" W& [; m9 i
7 H4 V2 G3 j; h5 \' U+ B0 B

对定性特征独热编码

$ F9 R# n- g/ t4 M

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

; W1 Z/ J2 |' T' Y* b7 o$ ?

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

2 Z9 P: \. L7 ]7 b" r* o/ h# p

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

8 C8 ]6 y, Y3 u5 j B. e
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 7 `' k1 s' L* z from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder% e# g4 m7 G5 `; ~# v! t import pandas as pd& X& n8 K+ k+ ~( f: Z I 5 z r& P d8 C) i: B, ?# a print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1)* b+ r, H# Y% h: B+ H) l8 x one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)) - w) l8 Y4 j& n: H i; o" } print(one_hot.shape) # (150, 3) 1 g) ]( O! S9 `( N6 T* X' j0 S2 V6 |1 `- n' p dummy = pd.get_dummies(iris.target)6 Q" V* u- T% S# V print(dummy.shape) # (150, 3) + s) z, r$ F7 Q0 \
8 {, N! W: P+ b5 [9 A

缺失特征值补全

; I% o4 y$ b* n o( |1 J

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

8 `; n9 d6 F2 @# [5 [

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

/ R% h, R) D- e( I3 i5 w
from numpy import vstack, array, nan 7 `1 q+ o; z1 q- I+ U) g% P # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据9 X! f- N) D1 l' u from sklearn.impute import SimpleImputer" U" I5 Z, d: S2 Z0 }: k + c' K9 S9 P$ E# v # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN2 l9 K! M4 f; F) p; c) j% m3 N # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值), V' I0 k" m; p8 }) m imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")* |2 P; V- X8 L8 ?. q ' I# ^% i% V! C, h( l$ g8 o7 C data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) ! C8 a; L6 ~: k, B. Z print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]]+ H( c+ l+ U& h# |2 O result = imputer.fit_transform(data)7 _( t/ [% w/ Y1 e( Y+ i! x2 G5 I print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] 4 c5 t/ q1 Y+ i( ?3 e% ~1 b) A
- A0 o' y) Q" f2 Q& Y' Z

数据变换

+ s2 w# S& U$ K: z

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

) I; g- g' `4 ?. E2 \

基于多项式的数据变换

4 e ^9 n* z( e$ X* q) H1 ?/ G

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

) `9 X' _0 ?+ | ~

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

3 Q9 a) ?3 J/ Z" N

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

8 s/ E4 }3 H8 `7 V

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

2 a) S1 M/ \6 i9 {/ W& i
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换/ G6 c- R: M, a& g # 参数degree,默认值为2, J7 U* |# D3 k+ h) Y, T2 x* J ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data) A1 m$ c D/ F. @7 ~9 h# V3 Z) k print(ploy.shape) # (150, 15) ) \$ O, P& W: _$ X; h) Y print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] 4 q$ [1 ]) i& ]% Q% W8 D8 }
5 L$ m" w, K( w v6 c$ N- c

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

2 ]$ p- N7 D m+ k9 G; n: ?

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

) }* ?1 U! m' }; B% K

基于对数函数的数据变换

; S; n7 c5 r0 l2 N

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

. ^- S* U7 w9 r @ F$ k

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

: g- S$ p8 g8 J7 E
from numpy import log1p# L5 `3 B* `; b4 Y8 ~/ {! J, l from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer# n5 M, l2 r" w5 g # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射# o5 c8 D1 D, \2 N! ]1 } # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 2 J8 n3 c; ?* k' m # 第一个参数是单变元函数 % l4 d5 e. B. A; ~ S8 ? log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) 7 A/ t9 ~2 p" d2 D3 R! @ print(log_one.shape) # (150, 4) # V0 w- n& }# |* O5 i3 V# g0 P; E3 u print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]] ( i3 S' Q; n& S8 N
u% U# x. f$ d S3 O6 p& T( o- g

总结

6 G* B0 G. p0 a' l0 ?: j2 V t) ^

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

) e: {, J, m. x3 H- I
% [! j4 g0 Y8 ]) s' Z) z9 }

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化& @& h V6 `# K 2 F$ I+ @6 c' a8 X 0 K8 H& E e* C7 `% n4 D & I8 Y" r+ J4 m9 s3 g {+ t4 p ( _: o) V' f% f$ f! ?; h
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