浅析sklearn中的数据预处理方法

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0 A# u! c2 N% P& A1 U

简介

* e* e* p' R. V4 K- |

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

, |9 q( r" Z& z/ k; Y7 Z0 [

数据集准备

; P! j! a5 J2 F4 |# R8 i

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

0 i+ v( t- M7 }) j
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集) K' m4 s" Y$ s import numpy as np n* X9 d& j; Z1 b- K6 h , ?5 u( I" Y& \( W) R: ~, Q iris = load_iris() # 特征矩阵 ( w V O0 I+ ]; ~6 v3 ? O print(iris.data.shape) # (150, 4)+ [, ~' T( R2 D9 |# R8 ^5 L: k print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]8 Z* F" L$ Q+ g$ A; D; W" Y print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]( B A4 k4 @9 s$ n
% A" X. l; e" ]; G( _: o; w

无量纲化

8 s; e" Z m2 p. _* L

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

- I. @$ @- e" } J( g

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

# j- r; C( F6 n

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

$ b) ]: D- M% H' c! W3 h2 \& x

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

- E' \- _3 I: r5 ]/ X" P( \ r4 W

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

' K6 n2 y8 @, \7 c8 u" ]

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

! H( _% K6 S1 N# A p$ S" B

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

5 k( ~9 t U* g, X7 b( {

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

/ f" {% m' _3 E; B* ]. B

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

0 k/ u( _$ m2 ?; e5 ^) e/ x2 X

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

+ e9 k4 s& U8 k0 k/ X+ @ M( j4 G

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

8 \. {- r- ~& t8 ~+ h6 j

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

* a$ j4 a6 l! S( K) I* e" G
from sklearn.preprocessing import StandardScaler 8 w# P" e7 X& n1 w; n 8 K: X6 I% ?/ Q2 g. G # 标准化,返回值为标准化后的数据 # v& E) r4 ^4 Z standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) ! l, a5 |# r. g) \ print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]) X: I& p) T* q$ k3 _2 ?4 Y
* O; [ F: z- r8 u$ I, @: A

归一化-区间缩放法

3 [+ k2 _. y8 l( A" t

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

+ b6 p$ n; ?4 o9 u8 m3 R

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

8 V" b& x# w% {* @; r$ H }$ h0 Y

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

( L% S& H0 h$ M

常见用于神经网络。

" I7 F! S6 m, X! X* d. A/ T2 a

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

, D4 f+ c3 o! T( `$ \
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 2 M) G4 B1 K8 |5 C from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler7 {3 S+ q. r: o! N" ^9 v 1 K" @8 u L4 `, W/ E# d) ~ min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)8 x5 h7 k3 a- b7 _ print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]* Y9 m0 _6 R. ?" y* ?1 Y5 J. _
/ X, c" ]& I. R3 _& u. ]

正则化(Normalization)

' Q2 L( g1 M+ e$ l( O/ U

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

2 n7 c! x! _+ A4 G

常见用于文本分类和聚类。

' v7 [4 r' _! L9 b4 z# F

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

6 z1 d( h5 b3 d+ } _% B; @6 ]- b

LpL_p范数的计算公式如下所示:

, U" J, {4 K6 l, a5 q A4 [- Z! _

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

. z' j2 j/ a) P

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

+ M" {1 K0 ~! a* }

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

3 Y8 o7 [: x5 |4 W

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

! r5 L# P I! T' T

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

3 p: J, O0 J/ ~8 y* c0 V
from sklearn.preprocessing import Normalizer7 v0 l. F9 q5 x/ n) N* s3 a0 R- N * k! G- \3 k$ n) H norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) 0 `$ s! T' Z, w( ] print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] P4 p# G8 T! r
! `5 T; a6 H' c$ z" j1 Z" ~

参数说明:

% j& V" M3 r6 e$ Q8 H, Z

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

1 S& u9 ^ M# _0 ]2 I8 Z. v

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

; N7 G/ k. ?% y/ p7 k7 r. v6 s0 J

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

1 }+ v( I4 r- P/ E" A

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

" z# Z/ h3 F. P' \9 P6 p- \8 ~

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

/ U& X/ w9 f0 |' r, r' x: ^
from sklearn.preprocessing import Binarizer - P; S/ N* C B M6 E, D/ V l4 y) c7 G k& q" _) K% I' |# v # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 & e5 Q3 E7 q! M4 Z binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)$ p6 H4 I6 z4 G. w print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] ( {. y N1 @" [# h& `. _5 h
, L6 @* X" i8 Z i6 |; P

对定性特征独热编码

% \6 [$ B# \9 V3 B8 W- Z

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

5 K: C& L2 I9 _+ M6 Q

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

- ^/ f. ^9 E7 A$ A$ T. ^

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

4 K! z: q8 w5 L* K) s
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据" P1 R/ N `( ]9 n from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder 3 t4 q/ ^/ S, v; [' A import pandas as pd ) A5 @ w1 r" e6 N , F/ a4 T" o3 e& B print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1)! [# n# y i0 D7 e z8 t+ N/ d one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))' e, I( h; a. c' W6 ? print(one_hot.shape) # (150, 3)0 F& A+ p/ w. i$ F 4 Z) H+ K( D, N a& n, k$ L dummy = pd.get_dummies(iris.target) 5 X9 x4 b! K& j5 M L9 x. \ print(dummy.shape) # (150, 3)- R2 n8 [& @/ h5 f+ N3 Y8 x6 C
/ ?5 F7 k' T. P% q D

缺失特征值补全

; K4 W6 F" w+ Z1 I

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

$ d) o J2 Q' d% R. R

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

6 ~3 b; F, q, d
from numpy import vstack, array, nan % L- x0 H2 Y. K, L/ d # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据! n( c( X1 [! l9 m: Y from sklearn.impute import SimpleImputer , z4 ?0 q" I Z6 x7 I ( b& J6 Y1 o+ C7 M0 @5 \ # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN: T; I; \( k7 P) s% {! s1 \ # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)! n7 o6 m% }6 g4 L% M! { imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") ; i9 w+ _0 T- V# w- g8 k) D/ a6 g" w8 s! H. U5 i1 _ data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)), H6 y6 s, V% \; B& v* N print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] ) u: b' M" g; H6 F: e- m result = imputer.fit_transform(data) 6 Z- b) o2 H+ ~) g# Z R8 n print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] ) L6 [7 {; ?1 H4 @# j% A4 i- e
: g0 \& J' w3 G; I$ d

数据变换

& k# l+ s+ I( {4 i

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

1 P4 M. D5 Q- T3 i: e. a

基于多项式的数据变换

$ N) A/ D0 L, W, ^& ?, G! x

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

/ ]5 i% `( q% b0 U( u$ O

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

. O) U- B3 `8 M. K) T$ F8 }

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

3 e9 q- l7 c/ w3 v* l0 P2 N* y

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

# n( e- ~! e% D5 n
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换/ ^) d1 C5 y7 I: e8 B # 参数degree,默认值为2% _: m4 P, ^4 F @ k ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)4 _, n$ e# v" ] print(ploy.shape) # (150, 15)) p! L& K. o1 ]# s9 O$ q print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]]. j; p H9 i" L" s+ M3 @: j$ P
. }7 w- A! v) Z1 z u2 N

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

( W+ B4 K) W: E' i

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

% c) g/ y: K! p, M; ~" z

基于对数函数的数据变换

% N3 r! P0 p" h

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

; M9 F* M4 q* V y6 r2 q F- O

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

6 C) c, q( N2 v5 H& `' r& V
from numpy import log1p - s, J+ H: t& T/ K from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer. n- n- r, ^9 \ # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射- i, T0 z! s2 j" J J! {6 z # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换6 S+ H. w4 N8 Q- ~1 B, e( X # 第一个参数是单变元函数 - f1 r- I* R9 H' c7 O log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) . j- _2 P7 v& N- l9 N4 q print(log_one.shape) # (150, 4). m0 ]2 W5 n! [% c' { print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]7 B! @* |1 U& X5 p% x0 }, Q" d. j u
+ s$ r% P9 H8 C4 \" `- f7 x4 j

总结

8 r+ ]5 v3 Y' ], B) A0 e: a8 ]

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

' N; Y1 q: d6 u8 C' `
% e4 C0 @8 Z; g/ q+ D$ x4 [0 q7 f

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化/ r! Q" r5 }) C8 Y# \! l! H* Y5 | % `0 ]% f# n2 v& e4 c: H ' i, z% L0 r' ]+ h! R 3 T: V# Y8 E3 \) a2 W1 F% O, e* i' A& l+ f Q0 p, N) Z5 V
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