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浅析sklearn中的数据预处理方法

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! \ s' U) B( S1 w7 ^! L7 G

简介

, @0 f7 x6 M# M2 n

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

7 \( o. K0 h2 @! ]7 K" y

数据集准备

" s6 a& V4 j' b, W

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

! c/ l# F! N9 v. S: K
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 1 n+ S d0 v" f import numpy as np * {: z7 Q2 |- m# ]" E2 \4 {# k7 v2 e iris = load_iris() # 特征矩阵 ' I/ ?$ h6 Q- d/ v. V4 K" \/ R print(iris.data.shape) # (150, 4)- j. B* ` r) D2 c print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] & |+ {% Z0 r- k+ Q- c6 C print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] % ]7 S# x( X+ s/ R' H/ ]1 I
3 E; u; a8 u6 L

无量纲化

4 Y: _3 B; Z3 ?8 P8 A; P3 K

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

w/ d8 `4 O5 ~! M6 _

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

_9 b9 e8 a9 V* K5 U2 ?, M

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

Q' y7 Q5 P% F( {2 K8 u8 L. h

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

/ m: t. j& Q6 u( t. C3 O! s

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

7 v6 B1 @/ P5 [. G$ Y

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

B/ T2 x& }; P9 P- a$ y

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

9 `8 b2 r( I+ e7 q, {! X. |

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

) Y7 Z, z9 S+ X4 ?1 W( Z

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

' j: i7 |6 M) y% R" `

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

' z" J; w; y8 u3 D; z

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

' P u' p! s( h5 F

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

9 o* ^5 H( D( |+ q! U2 k; B! X4 F& a$ D
from sklearn.preprocessing import StandardScaler 8 h6 E5 w2 h/ ^9 y# W ! F, x5 {. b& k) L; o* w # 标准化,返回值为标准化后的数据3 w! u- o6 l# U9 C standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) / W; C( Y: [" \# l2 x print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]% U) w4 T! z6 \" @
$ ?. T4 d' w* U8 P/ D/ A

归一化-区间缩放法

& _3 ^. y# `: d' Y; I! N9 T/ a

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

2 |! U% w& H4 _

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

+ a1 ]& x( c( ?6 z7 ~

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

0 B: m, ^+ T- N) G' M' D0 a

常见用于神经网络。

9 C+ O+ ~1 Q2 e9 ]% t# w6 X

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

7 b9 ^/ h6 ?7 k( T% U7 U
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据/ I2 G$ n) X# G6 Z) n from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler, L9 t' u6 l" A* r; O7 s& Y" Y! T 5 S5 q* y+ x G9 c+ }0 b min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) # b9 M* C }' L& t9 C print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]] & M8 D% g( W. w: V4 c. `) y
/ k G% O T0 _$ i2 R4 \

正则化(Normalization)

! r; x" E* n% Z

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

7 |2 i1 G4 _6 \+ X

常见用于文本分类和聚类。

0 a0 u# u9 J2 j7 X) Z

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

& _1 Y! W% i7 ?. a5 w2 n4 i6 {

LpL_p范数的计算公式如下所示:

$ Y7 L5 p q( v% {

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

2 X. L) y) P2 F, f

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

! ]) Z# O5 e) t3 d/ r3 z

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

0 C m& s' O3 y3 D% Q F7 z$ w# q8 i

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

! K' _9 U/ q- N* F a8 a

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

. f q* E; H# d- V
from sklearn.preprocessing import Normalizer6 D {/ R1 I2 V f: O 5 G' C: n \; M+ r, G# } norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) 6 H7 {/ x) b* @4 [$ k& a0 y! u print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] 8 I, R' H) x3 O
9 i: E, f9 n2 X3 p3 Q

参数说明:

$ B F6 Z+ N* s1 K( c K1 A

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

6 I: P% I; O9 K1 [# D5 N0 B

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

5 X5 V# K3 C8 ^5 `( A W8 w4 [

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

4 I L. R1 L) I5 ?( t m3 D8 r

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

" R ?- m: K' n; D: g+ b

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

. ?! r4 f$ m) J' g
from sklearn.preprocessing import Binarizer: q; s% {7 z9 S1 H5 D0 }: h' X $ Y" i$ m6 {0 m: e/ Z # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 ) ^0 a! K; J& T6 s% k$ [( _" O binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data)- |6 t3 D4 o* @% g8 | print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]' c, s* R! f$ {: K
+ |/ N/ R+ C$ @8 M

对定性特征独热编码

' l. {, `2 W( Z' y0 Z

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

- }, e+ s7 S4 e: R9 ?

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

6 u0 K$ @1 P6 H. C% w

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

. g8 Q4 j% }) K' s7 f }7 ^
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 , ]# d0 \) ?8 O# l) D from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder! i# \/ Y1 T; |) A; C o import pandas as pd4 C% _) `7 s* L. f 8 u( O- Q, x, z* f print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1)) w. X! u! a! B$ x0 H' ?4 y: n one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)) - I% i& L2 f' a" X print(one_hot.shape) # (150, 3) ! i8 p3 w5 }% Z ?/ W$ H- h! b$ @3 l& H, U8 t- ] dummy = pd.get_dummies(iris.target), {/ C/ P. t, W$ }. p print(dummy.shape) # (150, 3) & k- ]- A% T& y" w' D V' u
! e/ q) m% d' e4 L( v6 @4 \

缺失特征值补全

( i# D& q( u0 O8 r8 y7 t K$ v. a5 b" p

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

) U v# t4 m! V7 ]' _

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

: t" K ?1 u% u t0 _
from numpy import vstack, array, nan; O) K- x% ~1 O6 j # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 0 f! U! B9 c- \9 | from sklearn.impute import SimpleImputer. X' W2 F8 o/ p' Q 0 @: y1 B' V/ C# F: Z # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN ) I, z/ p- R+ j) Z& t" Z5 I # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)- ~7 d! `3 C8 k$ M+ v# t* l( H imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") - t F) r5 b8 J. v0 x# L/ a! r % X0 B# s7 X3 K# s0 Z data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) ' d0 f, A( o) o. z print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] : _* g' x( [8 y' Z: {& r( T result = imputer.fit_transform(data) + w: T# N1 e; G# y- T1 R% J3 a print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] ; I6 i5 \- n7 m p
) M3 i5 x5 @) G6 J+ F9 b# r' K5 N

数据变换

8 ]2 L1 ]6 ^- q u& y% e

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

* P9 A6 H: `) o7 h: e5 `

基于多项式的数据变换

4 A: z3 p3 T* W# |! a

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

& ]7 ?/ X9 X w

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

3 D+ ^) U F$ @0 t

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

) o N% L9 A9 A6 Z d

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

/ E0 W z: ?" o, h' Q
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换- u- c# X* Q2 ~+ E. g! z # 参数degree,默认值为2 4 w7 a- i2 Q9 W2 f' @* J7 u ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data) ! l( k2 j8 U" e {+ o0 a9 V. m print(ploy.shape) # (150, 15) ' s( i* m/ ^0 c# B print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] / N( ~# q7 G7 ` S1 d
% i: a" O6 e* ~$ w; t6 d( \! p4 I

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

8 X f. v+ g; e+ a3 H/ m0 O

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

\- m, A; p1 [- T8 U

基于对数函数的数据变换

. o$ `7 w; t' M8 f! B* p

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

4 o4 S* i6 O/ [+ ]' d" A5 ?

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

! K& j3 O8 Y0 s, Z2 o& u9 Z& w
from numpy import log1p 6 d+ W& L: ^0 N* \8 o- r% E from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer* P! ~ w9 h6 s& u' H: q. S # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射& V; f- G: W9 ?+ b # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 4 q6 F# U* t0 V7 o! { # 第一个参数是单变元函数 % {; b) r- P" D log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)2 u1 X; s7 ^+ G$ T print(log_one.shape) # (150, 4) 8 u' t1 s8 m F( J6 E& H print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]] F2 l) E' o' m: i$ M$ y
* ^( {2 `( M# E; U+ p; _7 X5 V

总结

! |# h- I5 e4 G7 O( i& u. K, J! D

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

9 h& b: H( p/ }$ t2 m
8 \* B& t5 F: R3 ?1 ?) k5 O" u

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 " p6 n& l) j! V m2 s' L' ]8 w1 s* d& I/ ?1 [5 | : j& S$ ?4 {8 o( F Z 1 h0 d! Q. [( c' N5 q9 A$ ]1 p- W: A+ b2 W$ ]* v) s+ o
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