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浅析sklearn中的数据预处理方法

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3 Q i. |; [/ J0 D* U: Z4 \1 h

简介

/ ^5 f8 b3 x) c; }. l

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

7 N) Y q) T8 _/ R9 @6 i

数据集准备

/ y. N4 h; Y: b2 [! ~

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

* C% l; B3 {/ ^' z! n; O3 A
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 7 [" p: s3 E0 ~' w- g; u# n import numpy as np* Y9 z8 s% @" z% H! ` ! @9 j; X3 G' Z iris = load_iris() # 特征矩阵! i( }2 R7 t, `4 h print(iris.data.shape) # (150, 4) + v& p/ y* {, L! x% p' R3 R& P print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]: b( D( T q3 \0 w: Q: p! Z/ [ print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]9 U7 U1 F0 s9 ?: D3 g7 {
8 _5 ~ r( D7 m9 {2 e

无量纲化

4 V: i! m9 h E

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

0 [ g# J$ Q, I6 ?' `5 s1 `

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

7 h+ w( k9 N- S3 Y- }- A

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

' t" u, C1 R3 c3 c

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

1 y9 b* b' E5 y2 O/ K8 p, J

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

, H! c5 {! Q; o% K- q+ d4 k. X: l

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

" S: p5 k2 a" c. E# U6 n; B

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

9 x# |( s2 `, k" \, r: I

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

. g; w9 k! U/ ]

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

. ~& y$ M0 F+ L, Y" s" F% B

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

3 p, C' w, u0 i: |1 ? ^: ~* I9 f; y

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

# ]1 _ ~1 k, h% D1 x

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

' }) G. a Y d' J
from sklearn.preprocessing import StandardScaler / V4 T% g' w5 P 5 h7 ~( n( M9 U* d; H # 标准化,返回值为标准化后的数据! D o$ W3 q% M0 D standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) 4 c& G& v9 f: x: h& K8 u, ~ print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] 4 k( O: S9 U O/ n
9 g" q3 l3 y4 I* w4 u1 `: k

归一化-区间缩放法

6 P, q' W& X r

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

/ s! v6 L# |9 l9 R0 }* h" Y7 N

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

5 P5 o1 \) g( {4 `$ s y

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

* g' i+ d* R, o. |

常见用于神经网络。

4 |* X7 Y/ s/ E0 _

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

' C; y* b! `8 x2 v
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 ! d) _' j8 S% Q5 a1 ^6 n% L: E from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler7 g8 N3 F* t9 J5 q+ [8 c ) ^0 n& h3 q) Q$ U7 ~6 _/ d# ~0 _ min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) , A+ K( P9 q, k( h, I2 N print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]] ) x, V' |/ k( }) l
4 { o2 W2 Q4 Z: |* @2 V

正则化(Normalization)

! G& i( M0 C/ J( W" f W

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

8 V! c- f9 W! U v/ ^) A

常见用于文本分类和聚类。

# [8 c5 |3 L* g9 e* E3 ^

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

) u% k" T8 F0 \6 i/ M5 k

LpL_p范数的计算公式如下所示:

6 [* w( }9 U. d* @( D8 A

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

( s, t3 z. M7 H$ _3 ]

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

% q Y/ f. Y, C2 U z

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

& B+ g( L, D2 U+ g5 O! k- f5 t ~# j

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

% u1 u" k* M3 k1 c7 k' u

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

$ h1 ~! M' z# i1 ]: N! H6 U; {8 i
from sklearn.preprocessing import Normalizer ' X% ?% d0 M. c1 f* ^5 l8 T 8 t( {6 E* H1 h/ X norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data)2 u, O6 S+ N! y, `0 p6 W5 a print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] w1 n* Z) M6 F+ }( i' t1 S
1 h3 Y T4 z4 \9 w" V/ l/ I

参数说明:

8 _8 ? y4 v# P" Z

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

* \7 O# [) S7 S( Z3 w2 e: X9 y

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

/ n' r/ c7 S' B6 ^7 f! P9 P

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

. P7 K& a* X" M& g0 u

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

5 Z% E+ _* p. r+ U$ R* S

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

' R7 ~4 `/ s1 p7 h* F
from sklearn.preprocessing import Binarizer$ H5 F4 p8 e# I0 E; \- r" i 4 H2 X/ D6 N' n6 N6 t5 s) d # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据% h3 Y/ q7 \; d9 L binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) " Z& {$ S4 f$ c% D5 w8 c print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]]8 @9 B+ K5 D9 l) `
5 s5 {( P, A0 H4 p

对定性特征独热编码

; m2 ?, V7 c: n4 h: i

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

4 C* {# Y/ Q" f9 @& Z

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

* ~6 Z/ Y c7 p# c6 b# ^7 Q, L4 d

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

$ @, X3 ]# t1 }" x' ^& |8 B/ `8 [
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 * ^( z& G. r+ L' C% F& \ from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder. [- x0 h; M& L3 Q import pandas as pd$ i/ S9 V# H6 a z$ X* F 5 p1 ^) U) W3 Y* M4 o+ ]6 k) z print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) 8 c+ ^0 e7 n7 j3 [ one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)) : Z9 e8 [* `% g2 E% M( q3 A# E; \ print(one_hot.shape) # (150, 3) 8 C( f( [' l, a4 l; {! b/ u" P' B" o( ^1 H Z dummy = pd.get_dummies(iris.target) ; m* [2 ?" }9 n8 z- z# a print(dummy.shape) # (150, 3)4 {8 b6 r: P6 b2 x, q
, ]9 |$ S7 l! c _

缺失特征值补全

0 q+ b0 d$ O2 R8 o, O

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

! j" V4 I1 j7 t

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

0 Z, `- s0 f2 Q0 N9 J
from numpy import vstack, array, nan; e% s& E8 l& S& g. `2 D # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据 ! b1 M7 y2 e" E$ M6 W from sklearn.impute import SimpleImputer1 O/ ^! h h8 V: \ & r7 o8 t) j' v- V# u' ~; G # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN ; m2 i) O' v8 m7 p1 K # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)- [/ S1 D) }1 q imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean")5 h7 e% ~; x& W0 K1 w : h' y* z" j1 b5 h: t data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data))4 h+ f% G; _( c7 B3 y' b print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] ; r+ u0 l V( U result = imputer.fit_transform(data) 5 t% p; Q# S1 J$ m print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]! C j2 R/ y$ I/ H0 T
3 [/ {) j3 o2 n' l! J

数据变换

3 f: t/ j$ ~! |, s& ^6 i" N

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

6 e8 {3 `5 l, b' o4 m2 U0 G# \

基于多项式的数据变换

+ J. s. L/ H! ?% L1 o. t

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

- Z1 m& k, V7 j4 }8 f/ p# @

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

% x. D7 [9 Y) t ] q* `, P3 B5 S% {

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

# J! y) x# `3 g% D9 s

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

+ F; A. n$ T/ J v' p! G) {
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换# Q2 U( E: M5 w- o # 参数degree,默认值为2 7 c: f- J; t& X/ g ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data)% k% n# ~& p* P4 v print(ploy.shape) # (150, 15) 8 j3 i$ O. a/ r4 s* i) ?5 E4 @5 Q6 Y, i print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]]0 y4 {, c' T; l% y' J' o" @
% Q+ c# N, e c. q# K9 {

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

; p/ w O, S- H

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

, ~7 k- Y0 ~" c& G" J) ?2 j

基于对数函数的数据变换

8 p2 f9 }' u; Z+ o: }" f, P ?7 o% R

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

2 k$ {) d8 x' M' z4 \" h# n+ @

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

0 {: l3 Z# ]& q5 G; h" x; w* i& G
from numpy import log1p# s' P% ~! `/ X( z9 t$ K4 |# M from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer4 T* d+ \6 F) H2 W1 h # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射 - w0 `& D5 E) O9 T0 r # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换: k$ ~, Y$ F5 p" v7 Z. _( C # 第一个参数是单变元函数 ! c4 g% J2 ]" _ log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)+ ]) v1 D0 g8 f$ h- `* _; J print(log_one.shape) # (150, 4) 3 ^( l. S+ ]( o6 Q: r: x2 E! t print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]], |4 b2 s# p& a$ t/ O& O. S
& T5 i/ `9 C: S9 {

总结

/ _/ ~! n1 q5 Y; }9 ?" v; { o; }

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

/ m. {2 H# U9 e" k, N( |' a
+ }! d) n. ^5 B G9 [% T0 H

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 + B% X4 {4 i. B1 z _; P3 t, ~* ] & Q2 m2 L6 N; s+ W+ r9 v7 b! S% ~+ |0 y& T3 X, V # k! I! G, t- }( | R
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