浅析sklearn中的数据预处理方法

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4 U; L% ]" B! }1 [+ q3 d7 `7 K S

简介

) D) Q1 Q. u+ n7 s6 x/ L

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

* K6 v V- [3 g7 b0 S3 I- ]0 k3 K/ ^

数据集准备

6 ?& N6 y, y! X: y- ^3 ]- g

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

" t2 H% Y) J2 j) |! k8 K. R4 S
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集5 i( [( V% P1 X import numpy as np . t9 |/ s7 {7 [5 {+ l4 l* z; h: S. e iris = load_iris() # 特征矩阵; ]6 m7 Q) [) C; e0 o* } print(iris.data.shape) # (150, 4)4 C5 T ^: S8 H* H" f/ b* Z! s8 H print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] 2 g9 ?+ o* G" i- N& L; W print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] ; C7 _0 K. q) y. B
9 E; \ p9 m. }7 l

无量纲化

4 N: ~% U( D5 j3 ^% @9 [$ ?

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

$ V" Y1 K+ J& a% I

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

# H8 F. {5 F. b Z$ S" Z

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

/ ~ ]5 ^) R) r+ y/ K

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

8 l5 p5 S3 P7 `. P! Z' T0 B9 Q- L; R

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

$ `# h7 u6 Q: f" l, }. X6 R- x

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

+ g5 N' w7 \2 f3 E

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

: [8 f! O! ^4 c' ^+ g1 T i( P

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

5 p3 B( l$ P; i) w! i

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

1 F4 R: W4 B' c

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

; t) ]+ y/ e6 ]3 R5 {* k) A& ~) P

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

9 E1 l0 ?7 Z* e# e( V

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

; E1 u* H+ u6 @& n* ?) |0 y9 z |
from sklearn.preprocessing import StandardScaler L! m/ V9 w- ]' V1 @8 a$ Y; r : `. L5 r" |* }3 R # 标准化,返回值为标准化后的数据 : W1 a% i0 {" y3 N# w2 O standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data)! \# F$ A" }& m$ D print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] ' X; a2 c+ }4 t" C1 j: T
& d3 F- r$ J3 F, a

归一化-区间缩放法

! M; H3 t5 W& r O: y2 J

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

/ x: F0 ^8 d; X6 Y

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

# d) L7 R/ J- q2 l/ w7 Y S3 o

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

7 \+ ~0 G l! w

常见用于神经网络。

" `- B) L) R$ H$ g

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

' y" `% H1 W! ]9 y
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据( z4 S" y& Q$ q1 a6 V! P+ x from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler+ K* P1 N! e0 d B0 ^$ t , M+ i2 u+ O# h( ~0 f. Y min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) 0 P5 z. {4 x, {1 m, U& `" t print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]' y0 a C% I/ H6 H! Y8 B# M
. V" y8 I6 ^3 ?2 b% X

正则化(Normalization)

$ Z& ^: d5 k% L

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

, B: _6 \8 S/ C0 X) P

常见用于文本分类和聚类。

* a. x/ c- y/ b6 @7 E" h! F# ?

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

- L7 l6 T+ \' W; g

LpL_p范数的计算公式如下所示:

! p1 i Y i0 @' C) K- L6 K

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

# p0 t7 S) }5 z' h

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

" S8 f1 d* v2 u% q: A

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

4 V1 z7 C1 w/ V3 c. A; J

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

) k! M, j- I7 G7 I. H$ z0 \- b

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

; E2 G, y$ \5 \2 Z1 U
from sklearn.preprocessing import Normalizer( F2 |, [& d6 s% D& n , Q# r3 ^2 A8 n( u( C9 g norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data)# M2 c' E0 b5 @" Y+ S* Q+ c1 h print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]8 e4 O$ I2 \! W3 ~! h+ ]- K/ @: l
1 L1 H6 z' S$ d6 o& k: |

参数说明:

$ B4 ^) R% m8 g: `3 T

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

4 L- B' B4 ]5 R9 E. F- j/ ^

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

; C' z9 Z: m+ k. ^% t

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

3 m3 j2 c1 O# K% }( B& G& O

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

. l+ H/ e0 r' t2 _ z( @1 L8 s2 u; v

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

2 O4 h9 G+ {% N: j
from sklearn.preprocessing import Binarizer " X7 Z3 j0 b F! |6 ~( z % v- v. ?1 r' R8 G1 \0 R # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 5 n' _2 y1 `% \, ]6 @3 \0 w binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) , T5 ^% v2 \2 o( F4 h" _ print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]], b8 Z" I' S* [0 ]' T8 L4 @9 s! p
1 R) i' H, m" M% C

对定性特征独热编码

6 v$ W1 O+ k; g# M

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

1 j* o: `, n ^4 I' v* e, r

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

' o+ _6 A* H, O# o5 X6 C

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

* I- P; |7 M0 c5 z* a( g' ] s. R
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 U |- R7 C* W B- b: `' @ from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder, D& t2 Y' A) i2 |; Z' ~) k* ^ import pandas as pd& X! K4 }4 e' s1 c& S . z: q- ^( _: k5 K! r+ f! l print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) ; O3 u( n8 w+ h3 |# o3 {6 X one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1)) & L/ j2 P% W; }$ I8 @1 q+ X; _ print(one_hot.shape) # (150, 3) 5 [3 z1 G9 n5 ^8 V / f. v, i! j* S% N dummy = pd.get_dummies(iris.target)9 Y& z5 t. N4 k/ C( `9 t print(dummy.shape) # (150, 3)" l5 \& a- J6 Z, U$ F( d( s/ j
8 F! x' l9 J" h) d5 M; m0 D _

缺失特征值补全

* x- C$ t% Q) [4 @ r2 O6 W

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

/ x) C/ L6 o& ~3 d7 C- S" o

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

5 p( h2 }% w' F. C
from numpy import vstack, array, nan; v% z6 a% B1 I5 a& x # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据0 r% W( C4 v8 C from sklearn.impute import SimpleImputer 7 v. _2 E W. L1 F+ J/ a8 Y: l9 \ # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN i% l2 _: z5 ~* M$ {7 ^ # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值)' b, k' m! d) L# ^) ?; I/ i+ d8 i imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean"), b. {3 r6 ?- |7 O( I6 ]& E ( L |8 M6 f+ y* ` data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data))+ ?7 S; B. [- ]+ O print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]]7 K& l1 t- v$ z }: Q H result = imputer.fit_transform(data)( [$ {3 _ t1 O) h3 i' H print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]]4 a& A0 q- }$ D& l8 R
: c: @; ^8 i! M- R `

数据变换

7 Y; X* D: i3 P. Q# W

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

' T3 ^6 I6 Y: s2 e8 V1 }$ x1 i0 e

基于多项式的数据变换

1 T& O9 S& t R

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

; ^) ?# r) y" q/ _0 z) A

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

# R, Y- Q3 ^; W6 T5 e# Y

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

: s$ ~$ M5 X: k* G1 D/ B

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

5 q+ q, s0 Z: ^! g2 K3 q
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 2 d% ^6 F8 L5 w! _/ s # 参数degree,默认值为2 * a% a2 P7 ^5 W' u2 Q ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data) q% W6 ~& C" w. v print(ploy.shape) # (150, 15)$ \ q9 d. l% H) z7 U. y print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] - _% c4 N! R6 @: \1 N
% g$ m# f8 L- O$ B$ E

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

. G" B# p; `6 P$ M8 h0 l

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

1 ]- R- q% ^. n3 H: H% A: b

基于对数函数的数据变换

3 T( f/ q4 E$ a0 E# u' ^. Y4 W# y

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

* ]+ s, K( p$ i/ f, M

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

$ O5 r6 \8 ~: k s5 e
from numpy import log1p' Y8 p M( e9 C0 E7 \ from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer% Q7 |8 i; F- u6 g+ L H, ~) R # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射+ _" w* D( d8 v# ~5 G7 H. h% L- C # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换' v H+ Y* R. m' M# l/ G" h$ e" b # 第一个参数是单变元函数 9 u/ q$ z2 }) ~% R) q( B" e log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)6 K& A9 t; B" }& K3 T2 y0 M( \ print(log_one.shape) # (150, 4)) B% ]8 N8 @0 L print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]]2 {7 U7 [' v2 |1 D) E. Q: J* m
e, i8 {( w! ?* f

总结

( l, o: s' |0 y: F6 N

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

8 r" t& p1 N( {: k
f; H# ^/ K$ D6 c. Q% E+ c7 O$ s

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化" S" v; n, B( ?! u& J9 m 5 m0 u. |" j3 o3 E* G0 \, K 7 D% L. j+ g/ z# E- ~ 0 J$ f/ s3 E( ?7 \. M/ y5 k# O/ T& g9 `, U8 G; h
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