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浅析sklearn中的数据预处理方法

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, V- e. Q" {# k* Y5 I9 p, y

简介

1 k$ T9 p/ D& Q" @+ p6 p5 u/ Z& t% l: v: _# W

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

3 ]) O/ ~& H9 j9 Q) b4 `0 V

数据集准备

! p4 {" k: i4 s6 ?5 t# Q4 s6 W [

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

! r; w$ X) a$ [) Y% }0 g" ?9 n
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集) C* ]+ A1 |+ O1 T import numpy as np 9 Z) d" Q: F S# C2 d9 V! q# j, v 6 Z. j: Y% ?& z/ y( ^ iris = load_iris() # 特征矩阵* L9 @/ f0 A9 G. `- J& Q8 W print(iris.data.shape) # (150, 4) 9 f6 x6 ?8 k: V: D# q P0 Z. T4 j print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]] & F* J7 e( q8 V print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2] " d9 V f+ G0 ^
/ G' ~5 P3 u8 I+ f9 Y

无量纲化

) A( Y/ e% V( C" z: w! P% G

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

2 s! B6 e o5 @5 V: a2 h, n1 p

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

- n; F0 a# h! N' ^1 P

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

) |- g& u8 P1 I3 f3 _# W f

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

' R* _6 w4 |6 o R9 }

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

1 m+ D; k) p" e

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

5 c. y+ b j4 d& H( Y

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

0 C5 g7 P0 G, L: S. M) G

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

6 ^% c# I3 {3 i6 |

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

+ a8 _, E; {5 ] [. M9 c/ j

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

7 z$ B0 \- K4 y! j) W6 A6 F

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

! r' ?+ K& |2 v. g; H

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

5 V' F# g8 U. n/ u, D
from sklearn.preprocessing import StandardScaler ; j# }( l1 [0 c+ b. D2 ~1 `2 D4 i3 | a5 b& {/ @/ r # 标准化,返回值为标准化后的数据 * U" |7 G; n0 j+ J8 [- r7 S- D. a standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) " h5 @" {0 K. G- t7 f print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]]3 n3 e$ O: ^- N0 e0 @) u8 M- N
, K+ s* a8 n1 u

归一化-区间缩放法

7 B; m a7 p" F5 W1 y% A" T- K

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

. h' k$ `) V: M) L6 X& l5 r

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

+ Y: F1 r3 h% P' Q

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

# f4 W0 X s6 p$ p

常见用于神经网络。

/ L5 n* `" S6 f

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

9 Q1 S, O; T3 F& N5 r' y
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据 9 H7 f& N8 Q& t; M7 ^! c. T9 A from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler : E* u# s9 l0 k, M0 w 8 ?% L( y" Y' `0 g min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)9 m$ X1 J( |8 @* J+ Y6 ] print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]]9 C' m. T4 q! J
: H% ^3 e- |1 w

正则化(Normalization)

, F: ^" m9 T; p. R3 A2 ]: s

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

9 ]5 G, Z# A. r3 u% X) p/ r- S; C

常见用于文本分类和聚类。

2 T7 b8 t' a1 h; w' ^

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

$ R3 w0 U. ?" @5 T: c

LpL_p范数的计算公式如下所示:

/ l. H9 \, P5 g

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

, p; w$ |! @' x' D8 s

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

0 B: G' S' t: J& P- L& w. y3 ?

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

4 ~+ @+ r2 S% |

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

5 C; [8 Y: f1 J/ g+ P) U( F/ C

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

+ q/ v) f6 P `
from sklearn.preprocessing import Normalizer 2 g% i" a! S' F3 ~ " W" T+ r7 `* f% T% p* F! k5 d4 d norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data) 1 c9 ]1 B. K2 A% s$ i print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] `( p- T% z! I
- R# v- O8 @+ D9 Z. b n# E5 @

参数说明:

% D2 i1 ]' o, A4 u% q' x

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

# b5 N! |. r; L

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

' g4 I7 M3 z: w3 x2 t0 F0 g

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

. {, A- g8 |! E& ]; G

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

% W6 h; Z; h* l0 ~9 x) G

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

1 ^; P: t; P4 `0 W2 {5 T
from sklearn.preprocessing import Binarizer ( N$ P: W6 \6 u0 x3 k; \+ F# Y+ p0 ] # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据2 q3 d& g2 A3 U% @# D) i. Z binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) ' t* a8 ^9 V# Y" v' y, B* [) A print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] " ~$ l! o: j; o( H' k, C6 c: Q2 C
3 F$ z9 Z$ X$ q; x

对定性特征独热编码

0 G; o" C# x9 K g8 o6 p1 c& [/ v

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

: F+ j* u" n/ }2 v

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

3 `: }* B' [ a! P# O- z6 u0 Y

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

Z' ~) G8 Q! W) Q: _' k
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 , p' P2 ~6 J: w from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder& W: H" u& A2 K7 p. K import pandas as pd 7 w2 q w+ i6 Z6 T1 P: X2 P & v4 t k6 h7 s( c5 c& ?8 h print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1) - i8 O) S3 L" a' W/ J" }2 E' p5 e one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))$ I. j6 @( z5 E* V/ {2 C print(one_hot.shape) # (150, 3) 5 }: K2 A0 x" w* ?: n9 D& r. K 7 h) W7 ?: x) V1 p7 X% M( R9 l dummy = pd.get_dummies(iris.target) 1 F O0 F3 n* p+ Q8 Q3 ^+ u print(dummy.shape) # (150, 3) - w; n& `; G- [# n! W* v
/ G* l. B3 Q8 j$ H2 H

缺失特征值补全

- L. C) s, p5 [

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

9 s6 U; J+ K; n& g2 d( s

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

7 A: z/ H0 v. z
from numpy import vstack, array, nan! }% y: l% E' O0 Y! T. n9 x( y # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据" G( \# D4 n. d# } from sklearn.impute import SimpleImputer- ], i; k3 _3 m9 t( e- z" z3 c + r! q' \- s8 J! y: S" R6 M1 [ # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN2 p3 p. G& c8 K3 _) r # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值) 5 k% h0 T5 i+ I+ E/ f# x imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") " S* l: `1 r! g: ?% _+ U9 w2 } # w+ o. y/ \/ ?+ { data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data))+ w7 o' [4 U L print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]]; l, S8 i$ b3 k; w8 z" g result = imputer.fit_transform(data). E6 o% R( l; _4 ? print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] $ s1 b: R0 `' o4 i
8 ` @2 W5 ~' z5 Q6 l2 A+ W8 q

数据变换

! L( X: x, j2 ^ I; U- \

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

. P: M5 A; T; E$ z. m, Q

基于多项式的数据变换

2 z$ r# D2 M5 f; U) b+ x

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

6 ^) Q2 F6 S# Z$ v* h4 s- Z

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

* I G4 R3 D$ ^1 `

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

7 A; x! ~" [' t p' u6 b

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

`3 D* J8 n! W) N+ M
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换 8 @6 j" u7 b( j4 O3 ~ # 参数degree,默认值为2 6 p& y, q5 @9 u; B- B. { ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data); Y) J4 C9 j0 B8 C+ T1 ?/ ? print(ploy.shape) # (150, 15). {: W# c% E j; o7 I7 g9 `# ] print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]] " ~8 V) T& t3 D% r8 @. t
' f% m) q) L- l3 u L

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

u! V& D7 v/ h! u% `1 l+ h5 V

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

X, B: Y# m! I' N$ H$ w: X; w7 D/ T; {

基于对数函数的数据变换

( w0 [9 P1 a$ d, {4 Q, i, N

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

8 [) F/ {' U& W x3 t( q `

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

' W" Y' |" X6 }- G
from numpy import log1p3 X0 T; U5 u- V5 {) U+ n from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer$ P+ H5 p9 N0 @1 ]% e0 d& m # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射0 A2 q: p% ~3 T f3 `, k9 W # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换2 g+ s( g$ P }$ W+ h7 D$ G # 第一个参数是单变元函数' t% G; w3 K( e9 r3 K log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)$ v/ ^2 F, d+ D$ n6 ^8 {+ z print(log_one.shape) # (150, 4) 8 O* Y. b; q$ q k: I6 p) N print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]] - f# B" ^' \4 B- V& U1 R
$ i# {0 w9 D0 A! Z. k6 X' Z

总结

7 k! I6 _ X9 h

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

5 X# `/ \ p8 B! _# k; z
, J# i+ r& z7 x4 X# u9 U' U

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 , m3 Z! M0 i5 D ]; Y- s- w# j3 S8 y- y2 X1 a% D* c 4 \4 d5 V% Y! |' b: d) O! I. ?5 U 2 X4 i9 Z8 {9 G- a" t" p
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