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 近日,华大海洋在国际知名学术期刊Aquaculture发表题为“水产动物基因组学的研究进展及其在分子育种中的应用”的综述论文,华大海洋研究院副院长游欣欣博士为该文第一作者。 该综述分析了水产动物基因组测序和组装分析的概况,探讨用于SNP(单核苷酸多态性,single nucleotide polymorphism)标记分型的测序技术和SNP芯片技术在水产动物研究中的应用,总结了SNP标记在水产动物高密度遗传连锁图谱构建、数量性状定位连锁分析、全基因组关联分析、分子标记辅助选育和基因组选择育种的应用案例,并比较和讨论相关的研究策略和生物信息分析方法。据统计,截至2020年1月底,国内外共有52种水产动物的全基因组图谱发表;另外,针对水产动物,采用简化基因组测序技术的文献71篇,采用基因组重测序技术的文献12篇,采用SNP芯片技术的文献41篇。目前,在实践中可根据物种基因组信息资源开发和商业育种的成熟度以及基因组大小等因素选择技术平台。
/ w! h/ `2 P ]' p! {& l  值得一提的是,基于连锁分析和关联分析的策略,目前已有大量跟性状相关的SNP和候选基因被识别,这些数据资源为分子标记辅助选育和基因组选择育种提供了基础。此外,该文系统介绍了目前在水产分子育种领域较为成功的案例(抗淋巴囊肿病牙鲆选育和抗传染性胰腺坏死病大西洋三文鱼选育),并讨论了基因组选择技术在水产动物育种应用的技术路线和存在的问题。最后,作者提出,高通量测序技术的快速发展以及测序价格的持续下降,使得基因科技在水产领域的应用更加广泛而深入,同时,随着组学数据的不断累积,我们需要对功能基因学进行系统深入的研究,从而为基因组选择和基因编辑技术等前沿技术在水产动物精准育种的应用提供指引。 fill=%23FFFFFF%3E%3Crect x=249 y=126 width=1 height=1%3E%3C/rect%3E%3C/g%3E%3C/g%3E%3C/svg%3E) 点击下方,即可查阅论文原文。
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