浅析sklearn中的数据预处理方法

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; {/ J$ v1 ?9 a

简介

. l6 |+ n ~' O

通过特征提取,我们能得到未经处理的特征,这时的特征可能有以下问题:

不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分,例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用哑编码的方式将定性特征转换为定量特征。 假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。哑编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。存在缺失值:缺失值需要补充。信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,之前提到在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。

下面我们使用sklearn中的preproccessing库来进行数据预处理,以覆盖上面遇到的问题。

: Q! `7 S6 x, ?5 L. q

数据集准备

+ ~2 k! D- C$ f" F

首先,加载IRIS数据集,代码如下所示。

4 e: m8 V/ c9 n4 g6 U: P# M* M+ `* @- m
from sklearn.datasets import load_iris # 导入IRIS数据集 E! H/ u; u0 E& m. V import numpy as np ; v9 U, `) f- s( n 1 b: w, h) \0 _! i iris = load_iris() # 特征矩阵2 g2 D% H% a% ?) Z+ `1 n print(iris.data.shape) # (150, 4)% Z' o* Z- z/ y, k# X* S0 B' L print(iris.data[:1,:]) # [[5.1 3.5 1.4 0.2]]4 Z) W0 a6 c# t( r; q print(np.unique(iris.target)) # [0 1 2]+ ~% ]6 {+ J3 f1 ?8 B/ ?
' Q/ X$ @/ V0 J

无量纲化

3 ?9 ^6 v4 P2 U* X3 }

无量纲化是使不同规格的数据转换到同一规格,或不同分布的数据转换到某个特定分布。

2 }( U; J2 o# G

在以梯度和矩阵为核心的算法中,譬如逻辑回归,支持向量机,神经网络,无量纲化可以加快求解速度;而在距离类模型,譬如K近邻,K-Means聚类中,无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。

/ ~7 R" x/ f8 z/ y* ]& @

常见的无量纲化方法有标准化、区间缩放法。

8 F8 v2 _5 u( u9 _2 T0 u

标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。量纲与无量纲的区别

( i$ h+ K% w" i1 F4 q

量纲:物理量的大小与单位有关。比如,1块钱和1分钱,就是两个不同的量纲,因为度量的单位不同了。

$ I& o/ J8 _$ h

无量纲:物理量大小与单位无关。比如,角度、增益、两个长度之比等。

7 o- Z/ C9 g! i; f1 |, W

标准化-零均值标准化(zero-mean normalization)

- x; F' g! i" E- k

标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。

6 j$ U" t: R+ Q8 R. [9 Y

简而言之,标准化将连续性变量转变为均值0、标准差1的变量,标准化需要计算特征的均值和标准差,其公式表达为:

9 w2 T- u' D% @. \# K

,其中是均值,是标准差x′=x−x¯σ,其中x¯是均值,σ是标准差{x}=\frac{x-\overline{x}}{\sigma} ,其中\overline{x}是均值,{\sigma}是标准差 \\

. k: E, ]' W+ J$ o( s) g

常用于基于正态分布的算法,比如回归。

& ]- B& m' k: y0 g

使用preproccessing库的StandardScaler(基于特征矩阵的列,将属性值转换至服从正态分布)类对数据进行标准化,代码如下:

- U; H. q' e% N! ~& c$ l3 F
from sklearn.preprocessing import StandardScaler 4 K& T3 D/ E) V/ |! ^; F& ^, h5 h+ k1 B$ f; f. D! f7 _ # 标准化,返回值为标准化后的数据 . [" E) }. i5 N* U) e standard = StandardScaler().fit_transform(iris.data) 9 o2 v2 u7 `( g$ |$ Z5 } print(standard[:1,:]) # [[-0.90068117, 1.01900435, -1.34022653, -1.3154443 ]] 7 d. o) V, b8 u# R% q
3 K5 E! G* h6 W& b1 W* a% m% a9 [

归一化-区间缩放法

; C! N9 z I, J7 m O, x

区间缩放法的思路有多种,常见的一种为利用两个最值进行缩放,把原始的连续型变量转换为范围在 [a,b] 或者 [0,1] 之间的变量,公式表达为:

' h. g# ], y% i

x′=x−min(x)max(x)−min(x){x}=\frac{x-\mathit{min}(x)}{\mathit{max}(x)-\mathit{min}(x)} \\

2 J8 h2 x+ ^3 i; ?- B+ o2 g

区间缩放可以提升模型收敛速度,提升模型精度。

3 C& y+ d' @4 W" L+ o

常见用于神经网络。

, @# ^ J+ w$ s% X5 m3 b

使用preproccessing库的MinMaxScaler(基于最大最小值,将数据转换到[0,1]区间上的)类对数据进行区间缩放,代码如下:

6 {$ E* M3 B6 |* \9 U: h4 o" U: ?
# 区间缩放,返回值为缩放到[0, 1]区间的数据+ S$ \0 E3 P$ l from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler % i# A$ {# B& c4 J ) i5 C3 m0 P3 }3 x- u$ C% B min_max = MinMaxScaler().fit_transform(iris.data) 7 r9 Z0 c) M9 T6 C print(min_max[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667]] 7 ^+ R; i4 c0 {; t
: e% P6 u; K1 D0 P6 C# @8 x, ?

正则化(Normalization)

3 K R X9 E" M

正则化的过程是将每个样本缩放到单位范数(每个样本的范数为1),正则化的目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准。例如,对于两个TF-IDF向量的l2-norm进行点积,就可以得到这两个向量的余弦相似性。

( ]) K/ ]1 z6 r7 ^) M1 m) m, n" x. I

常见用于文本分类和聚类。

* m4 A- B: {" J3 l* O- z5 G! r

Normalization主要思想是对每个样本计算其p-范数,然后对该样本中每个元素除以该范数,这样处理的结果是使得每个处理后样本的p-范数(l1-norm, l2-norm)等于1。即Normalization的过程是将每个样本缩放到单位范数(结合单位向量进行理解,p=2p=2时为单位向量,其他为单位范数)

7 P/ M! y, ?8 ?! `

LpL_p范数的计算公式如下所示:

& V# C/ Y- G4 a$ [! n% w

||X||p=(|x1|p+|x2|p+...+|xn|p)1p||X||_p = (|x_1|^p+|x_2|^p+...+|x_n|^p)^{\frac {1}{p}} \\

/ K7 u0 L, A) I

可见,L2L2范数即为欧式距离,则规则为L2L2的Normalization公式如下所示:

2 P* a1 W! o; m* H1 i& M( a' q

x′=x∑jmxj2{x} = \frac {x} {\sqrt{\sum_j^mx_j^2}} \\

( E7 `# ?: ~ H5 h! X: X

可知,其将每行(条)数据转为相应的“单位向量”。

$ y; n# `/ B" g. N! v

使用preproccessing库的Normalizer(基于矩阵的行,将样本向量转换为单位向量)类对数据进行正则化,其代码如下:

* b$ R8 w8 f' Q7 V8 p
from sklearn.preprocessing import Normalizer ! M7 F- e# C: x* f6 o" [( U7 |8 ?6 T' t5 Z" x2 c+ s- M norm = Normalizer(norm=l2).fit_transform(iris.data)2 F1 o& s9 G! _, c, z# i print(norm[:1,:]) # [[0.22222222, 0.625 , 0.06779661, 0.04166667] ' M% a* m7 s; x3 k
" `6 y2 B$ X9 T3 B5 b& x

参数说明:

1 L$ ~, O' b* c$ w( H% g% O9 O

norm:可以为l1、l2或max,默认为l2。

若为l1时,样本各个特征值除以各个特征值的绝对值之和若为l2时,样本各个特征值除以各个特征值的平方之和若为max时,样本各个特征值除以样本中特征值最大的值

标准化、归一化与正则化的区别

标准化处理:把特征变量转换成均值为0,方差为1的标准正态分布归一化处理:把特征变量转换为最小值为0,最大值为1的区间正则化处理:将每个样本在所有变量上的值缩放到单位范数(即每个样本在所有变量上的值的范数为1)

定性特征和定量特征的区别

0 @! X7 w( q' K; p' {, T

一般定性都会有相关的描述词,定量的描述都是可以用数字来量化处理。举个例子:

定性:博主很胖、博主很瘦定量:博主有80kg、博主有60kg

对定量特征二值化

- K' \9 ?+ |3 M. k/ |) }5 ~

定量特征二值化的核心在于设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0,公式表达如下:

5 S- C+ K% K! J3 \

{threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\">,,x′=={1,x>threshold0,x≤threshold {x} == \begin{cases} 1 & , x > {threshold} \\ 0 & ,{x} \leq {threshold} \end{cases} \\

. ?4 @+ B3 m& ]3 z: q, J' x

使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化,代码如下:

2 J# i9 J7 r2 ~/ e- F& d Z# G
from sklearn.preprocessing import Binarizer$ p# ]3 A, n! a$ E ]5 \ : q1 O- C" [+ d7 q # 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据 . w/ M# u0 `' C7 w& O# v, ]- i binary = Binarizer(threshold=3).fit_transform(iris.data) : n9 s7 c3 T8 w2 C& u' E print(binary[:1,:]) # [[1., 1., 0., 0.]] 5 ?# S+ ~: t6 ]
4 Q. c! j% F( n, H8 C. K

对定性特征独热编码

{, P: [3 t8 h. A1 V2 [7 P

你的变量不是定量特征的时候,是无法拿去进行训练模型的。独热编码主要是针对定性的特征进行处理,然后得到可以用来训练的特征。

7 P% C; ?5 c& b: ^6 e0 o

由于IRIS数据集的特征皆为定量特征,故使用其目标值进行独热编码(实际上是不需要的)。

5 L& h9 E; z( Y: E" b

使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码,代码如下:

8 X/ w R! [/ {, s% ]9 {0 M
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据 , }7 @" i7 f( d" d5 g5 M6 c from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder! U2 X( m# o0 y0 R! i import pandas as pd, S' W% R1 u: g7 ~) p 2 ^* K& E# K( ?8 x6 ^$ s print(iris.target.reshape(-1,1).shape) # (150, 1)" O4 X, J. @7 ^ t one_hot = OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape(-1,1))- Y" @/ [7 _" U* g0 H9 b print(one_hot.shape) # (150, 3) ' d5 X3 t- V. q- b9 [0 ^ , \7 K- }* L5 q( p U dummy = pd.get_dummies(iris.target) % u7 q$ i" y6 @$ g0 e print(dummy.shape) # (150, 3)" L: J/ |& Y* p9 g, u2 v$ ?
# s9 h* W' D/ R _/ |/ d

缺失特征值补全

1 X g) v8 |7 z; V; H% M

由于IRIS数据集没有缺失值,故对数据集新增一个样本,4个特征均赋值为NaN,表示数据缺失。

6 L+ o3 ?. y; @

使用preproccessing库的SimpleImputer类对数据进行缺失值补全,代码如下:

% Z; `9 c& [0 }
from numpy import vstack, array, nan ' k' d. B, h7 F9 m8 F& j, ] # 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据4 T* G* A. L5 c6 ^* c' @! U! X4 u from sklearn.impute import SimpleImputer0 f; f. X, d& k& L: A0 p8 g$ H/ _ ! R) c- S* U' y* N # 参数missing_value为缺失值的表示形式,默认为NaN * V' Q6 S. v4 S' i1 J2 d7 h' D4 a # 参数strategy为缺失值填充方式,默认为mean(均值) # r$ ^5 c* E @* o2 t& Q imputer = SimpleImputer(missing_values=nan, strategy = "mean") 4 v5 A2 P! @; s! \' c4 H " _1 U" p5 m" J( \( m4 t( c: _4 f data = vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)) 4 E) K- }+ y0 a& o! ]( K, ~ print(data[0:1,:]) # [[nan nan nan nan]] 4 }- Z, { Y5 @. p& ?/ ? result = imputer.fit_transform(data) & b" Y; w1 r% \ U/ d2 m( T print(result[0:1,:]) # [[5.84333333 3.05733333 3.758 1.19933333]] 7 ?, l# o% ?0 ` V: P
, [0 H( V7 ~2 b* p( a

数据变换

6 B1 g9 \* L' N2 S, t9 O/ }

常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。

% q+ K! R& t [: s8 t+ `$ a8 i6 G

基于多项式的数据变换

) X. z% x( N6 {9 O7 T$ B0 a9 S

将少数几个特征转换成更多的特征,来增加模型的复杂度。

0 A% L+ _6 Q& v/ f8 t8 f

2个特征(X1,X2X_1, X_2),多项式次数为2的多项式转换公式如下:

/ s' g/ Z& M. H, R! C

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′)=(1,X1,X2,X12,X1X2,X22)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6)= (1, X_1, X_2, X_1^2, X_1X_2, X_2^2) \\

3 X1 p2 R" v7 X% Z0 K

使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换,代码如下:

1 ^7 A2 C2 a3 ^ y1 G
from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures # 多项式转换5 V* h3 {( W B# Y0 B1 l1 o/ w # 参数degree,默认值为2 7 }' x+ j' u( j( } ploy = PolynomialFeatures().fit_transform(iris.data); m1 S( @& p7 {" x% x* w print(ploy.shape) # (150, 15)* U: P- m# m; e7 L8 w1 i print(ploy[:1,:]) # [[ 1. 5.1 3.5 1.4 0.2 26.01 17.85 7.14 1.02 12.25 4.9 0.7 1.96 0.28 0.04]]# y! D/ u/ |4 h; I$ S
; ~4 s5 U8 a( {- B3 |

PolynomialFeatures类的参数说明:

degree:控制多项式的次数;interaction_only:默认为 False,如果指定为 True,那么就不会有特征自己和自己结合的项,组合的特征中没有类似于X12X_1^2X22X_2^2 的项;include_bias:默认为 True ,如果为 True 的话,那么结果中就会有 0 次幂项,即全为 1 这一列。

如果interaction_only=True,3个特征(X1,X2,X3)(X_1, X_2, X_3),多项次数为2的多项式转换公式如下:

6 E% a" m' J) |$ t

(X1′,X2′,X3′,X4′,X5′,X6′,X7′,X8′)=(1,X1,X2,X3,X1X2,X1X3,X2X3,X1X2X3)(X_1,X_2,X_3,X_4,X_5,X_6,X_7,X_8)=(1, X_1, X_2, X_3, X_1X_2, X_1X_3, X_2X_3, X_1X_2X_3) \\

% K Y2 c% }7 f" E1 d- M

基于对数函数的数据变换

- p, R! o- x7 w$ r7 i) J; U. g n

对数函数的数据变换是一个基于单变元函数的数据变换。

6 l/ A2 y, E; m* d$ N3 |( a

使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换,代码如下:

& o2 f7 D# @" T* m' f. G
from numpy import log1p5 K1 R) s% g: B8 O0 e- M4 I/ ~ from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer! n9 U3 s- U2 u # FunctionTransformer:自定义预处理函数,进行特征映射0 V# Q+ d6 B& e3 ? # 这里使用自定义转换函数进行对数函数的数据变换 5 y7 y0 d& w0 l0 O# ~ # 第一个参数是单变元函数 : k8 C; O) j" G( B log_one = FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data) 2 o) O, Z& c: p! e- x print(log_one.shape) # (150, 4)0 n! A b# C P5 [% J print(log_one[:1,:]) # [[1.80828877 1.5040774 0.87546874 0.18232156]] # S, U, s0 }0 g; P( t
/ p# Q- V' M: n# p) z' f

总结

; e& N' ] i( B* w+ W

数据预处理是为了得到整洁的数据,让模型能读懂且更好地学习数据,但预处理过程绝不仅仅只是以上的内容,很多处理过程与数据分析目的紧密结合的,本文只是简要的介绍一些常见的数据预处理方法。如下表格所示:

0 c0 r4 I, U9 j! g% Q% y
' s5 H2 C1 b0 F. x, }1 l" Q

参考文章

sklearn offical docssklearn中的数据预处理和特征工程使用sklearn做特征工程标准化、归一化、正则化 q/ {" ~1 {3 V! C7 n J4 a 5 N+ R2 G* m% f @$ U j# J2 X6 Z# L! n & I- y. E0 z3 M) R2 |; @ 7 H8 |7 B2 B& ^1 |- V9 J
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