' N2 b* G+ S( X# O4 U H l U% N0 H$ {
8 t1 f# ~( C6 C9 p& M) ? 文图/寇琦 李新正 2 X$ P, e7 [% X6 T* M
中国科学院海洋研究所
- J/ O: C3 \( C 本文节选自《知识就是力量》杂志
3 j7 x1 H" z9 z- b1 b+ H / q A! x" K( p8 r
我们知道,绝大多数的生物都是以DNA作为遗传物质的,并且不同种的生物之间,它们所具有的DNA序列也是不一样的。凭借这个特性,生物学家们设想:能不能借助DNA序列来对生物进行鉴定呢?
v' `! D6 F8 B, s3 C; S) |/ ^' I 进入21世纪,伴随着DNA测序技术的快速发展、计算机及互联网的普及,这一想法成为了现实。这,就是我们今天要跟小伙伴们介绍的DNA条形码技术。 % w* N5 U# t8 c4 a# X( s: f
, U' \: ` j. {7 [; b 海洋生物DNA条形码技术 / [7 B$ x, e, z3 e
DNA条形码技术与超市利用条形码扫描,区分成千上万种不同的商品十分类似,就是利用一段标准DNA序列作为标记,以实现快速、准确和自动化物种鉴定的技术。 1 V3 E* }/ O( P' o! R" Q
海洋生物DNA条形码技术是以各种海洋生物为研究对象,在具体操作过程中,它包括两个方面,一是海洋生物DNA条形码数据库的构建,二是海洋生物DNA条形码数据库的访问和使用,这二者是相互对应、相互促进的。前者是技术的基础,它为使用者们提供了大量数据与资料,作为一个资源整合与共享的平台而存在;后者是对该技术的应用,它在帮助使用者们解决一系列与海洋生物鉴定相关的问题的同时,也促进了建设者们对数据库的不断完善。
# c' \' s+ z$ |6 f 6 J) H/ E M7 i! @
海洋浮游生物标本库
* t9 d# m8 r) J& {* g0 K1 ~ 科学家如何挑选DNA序列?
$ V m3 j. L+ t0 i9 o! m 适合作为“条形码”的DNA序列,科学家们是如何选中的呢? ( m! W$ O& i9 F: Q* f) e
通常来说,能做“条形码”的DNA片段,要求长度较短、易于扩增、变异率适度(种间遗传距离明显大于种内遗传距离,以形成相应的条形码间隔)。此外,该目标片段还应当具有足够的数据库信息,以便在获得DNA序列后,得以进行序列比对和人工校正。 + M7 q0 ]$ G8 w' c/ k1 y
科学家们通过构建简易的进化树,并计算样本DNA序列的遗传距离,就能判断未知样品与数据库中已知种类的关系了。
b: Z' G" M( Y. Y; R 0 g Z3 Y5 z. f7 n, N5 z
海洋生物DNA条形码技术已经在众多领域崭露头角,我们相信,随着相关技术的不断完善和革新,未来海洋生物DNA条形码技术一定有更加广阔的应用前景。 6 W7 X P" j% T0 Y0 Z
7 A }3 [, p$ b" j+ O
) Y( i5 f* E0 f: o! i% e+ }
# _; H% R3 ] v( C4 o" J) n
$ T$ {' b/ J6 r# R* K/ w3 E
( u5 G' E0 C0 y2 g8 o |