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文图/寇琦 李新正
0 d& A) y5 J- o& ` 中国科学院海洋研究所 . u' D" l4 E) u" f- r
本文节选自《知识就是力量》杂志 0 E# \' t4 h- `) P n% x' v" N
/ V# Z3 P, z d 我们知道,绝大多数的生物都是以DNA作为遗传物质的,并且不同种的生物之间,它们所具有的DNA序列也是不一样的。凭借这个特性,生物学家们设想:能不能借助DNA序列来对生物进行鉴定呢?
! K9 l$ G! ^6 t) K* B 进入21世纪,伴随着DNA测序技术的快速发展、计算机及互联网的普及,这一想法成为了现实。这,就是我们今天要跟小伙伴们介绍的DNA条形码技术。 2 J& a6 e; w( o: v& a8 l& l5 _
: c& m7 j1 K3 Q3 a7 q1 f 海洋生物DNA条形码技术 - U# @) W+ E% l: d! h1 c7 r
DNA条形码技术与超市利用条形码扫描,区分成千上万种不同的商品十分类似,就是利用一段标准DNA序列作为标记,以实现快速、准确和自动化物种鉴定的技术。
2 b' d: S4 P5 T2 \ 海洋生物DNA条形码技术是以各种海洋生物为研究对象,在具体操作过程中,它包括两个方面,一是海洋生物DNA条形码数据库的构建,二是海洋生物DNA条形码数据库的访问和使用,这二者是相互对应、相互促进的。前者是技术的基础,它为使用者们提供了大量数据与资料,作为一个资源整合与共享的平台而存在;后者是对该技术的应用,它在帮助使用者们解决一系列与海洋生物鉴定相关的问题的同时,也促进了建设者们对数据库的不断完善。 . t7 ~2 c U- X: d9 @
) |# y' A: N' y S }6 S( R1 z 海洋浮游生物标本库 * n! S3 _: `/ R* D
科学家如何挑选DNA序列? n% a/ Q0 s' ^ m* Y9 {
适合作为“条形码”的DNA序列,科学家们是如何选中的呢?
K0 e9 K M5 T3 V( k 通常来说,能做“条形码”的DNA片段,要求长度较短、易于扩增、变异率适度(种间遗传距离明显大于种内遗传距离,以形成相应的条形码间隔)。此外,该目标片段还应当具有足够的数据库信息,以便在获得DNA序列后,得以进行序列比对和人工校正。 / k5 q+ Z; x- d, }, X
科学家们通过构建简易的进化树,并计算样本DNA序列的遗传距离,就能判断未知样品与数据库中已知种类的关系了。 * z0 Q) |) B+ H
6 U" N( s. E M9 _0 C+ `6 A1 e 海洋生物DNA条形码技术已经在众多领域崭露头角,我们相信,随着相关技术的不断完善和革新,未来海洋生物DNA条形码技术一定有更加广阔的应用前景。
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