|
& O% n0 ^& @+ X- t
原标题：自然资源部海洋三所邵宗泽团队在Anal Chem发文报道海洋微生物活性物质挖掘的“代谢组学-分子网络”综合策略
/ z o0 E+ T' ^* h- |3 | 海洋微生物是活性物质的重要来源。但微生物代谢物组成复杂，活性化合物往往丰度很低，无目标的分离纯化过程繁琐、低效。
0 X, @! g2 N7 d+ P 近日，自然资源部第三海洋研究所邵宗泽研究员团队，立足海洋微生物菌种保藏管理中心（MCCC）丰富的芽孢杆菌资源，从中挖掘对高致死性弧菌（vp-HL，可引起对虾“玻璃苗病”）有抑制活性的物质。通过将代谢组学、分子网络以及质谱结构相似性网络注释平台相结合，建立了一种海洋微生物活性物质高效挖掘的“代谢组学-分子网络”综合策略，实现了活性物质寻找过程从“大海捞针”式向“顺藤摸瓜”式的转变。相关研究成果发表在分析化学领域顶级学术期刊美国化学会旗下《Analytical Chemistry》（中科院一区TOP期刊）。 ) s8 H. {+ y- v+ r( H5 J
研究人员对MCCC库藏海洋芽孢杆菌进行了广泛的活性筛选，从中发现了高活性菌株。以抗菌活性作为表型，运用代谢组学工具发现了造成菌株高活性的“生物标志物”分子。运用分子网络工具，预测活性物质是一类amicoumacin分子。进一步，在分子网络工具指导下，研究人员针对性获取了amicoumacin分子，并利用高分辨质谱、一维和二维核磁共振谱解析了其分子结构，验证了其抑制vp-HL的活性。分离结果证实了代谢组学与分子网络的分析预测，形成了闭环。
1 p% e) j/ |: \! D( g3 J0 { 这项工作揭示了海洋芽孢杆菌来源代谢物对抗新型病原菌的潜力。更重要的，这一研究提出了一种综合策略，利用代谢组学和分子网络的优势，不经系统性的分离即可高效预测活性化合物类型，从而揭示粗提物中的“暗物质”。这一策略通过精准定位分离过程中的目标，克服了分离过程的随机性，提高了天然产物发现的效率和经济性，将在海洋微生物资源应用潜力的高效挖掘与评价中获得重要应用。 . m# b. X$ M; k% g, s. H+ y( X% U
海洋三所夏金梅副研究员及其硕士生似鸿坤为论文共同第一作者，海洋三所王伟毅研究员和邵宗泽研究员为论文共同通讯作者。该工作得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金面上项目、所基本科研业务费和厦门南方海洋研究中心项目等的资助。
& J2 o4 P1 C# u/ u9 @ 
% h4 ~/ |. x; L: C2 f+ L8 S, ~
图1 分子网络预测和指认仅在高活性菌株中产生的化合物 ' O6 u8 V( W. B- S2 v" m/ r5 ~
点击左下“阅读原文”访问全文链接返回搜狐，查看更多 7 c' i# r" t& h Y- X
1 l' n r) i5 } i! h5 a. V 责任编辑：
% Z! c, ~: S+ E5 B
! s# C- l/ x5 Z) o- `# x
+ t2 X: y1 v$ d: |7 U# ^8 a | 
