|
; D9 W) b3 O* r3 M 近日，由青岛华大基因研究院规划的海洋生物公开基因组数据集（Public Marine Genome Resources, PMGR）系列在国家基因库生命大数据平台（CNGBdb）正式上线。
4 T: D" M8 h9 e2 q% {9 |9 S 海洋占地球表面积的71%，占全球物种总数的25%以上，是生命的起源地，具有极高的生物多样性。然而，还没有专门的海洋生物基因组数据库。PMGR旨在建成全球最全面的海洋生物基因组专业数据库，其正式上线将进一步加快海洋生物基因组学研究步伐，助力国家构建海洋强国的战略目标。 ! o, x" {, r7 p' O
PMGR系列包含5个数据集，收录了青岛华大基因研究院自主测序组装的基因组和其他公共数据库中已发表的基因组及其注释信息，为海洋生物资源领域的研究者提供全面、人工校正、便捷、实时更新的基因组数据资源。 + x( o" f. g: G k# I. B
PMGR Prokaryote
; l5 {( z$ @; @ 海洋原核生物，预计基因组20000+。
* }' p4 \5 r2 A X' n1 M
/ }) I. Y7 O/ X; r, L PMGR Fungi 0 E/ U. @( ?9 k" J( D8 I
海洋真菌，预计基因组~100。 8 K# R' r e0 E- M8 @+ v
" o1 x3 u. h( ?3 W. f' M3 p6 P PMGR Algae
}3 D: X: }: a( V' d& q) V 海洋藻类，预计基因组200+。 0 Z) h* }; I$ Z* S
* Y* Z$ f, h# M" u5 N7 O# U
PMGR Vertebrates
3 ?5 z: B5 E6 u! U. o1 C2 I, H 海洋脊椎动物，预计基因组400+。 ! K; |! I/ N: A8 s+ M$ i
9 t' ^# d- Y2 ^# G( ]5 k* S 大家熟悉的抹香鲸、蓝鲸、中华白海豚等鲸豚类动物的基因组数据就包含在此数据集内。 ! n1 P0 t! ]: R' c' L
& j ^' x+ A$ a _9 q9 D PMGR Invertebrates
4 A. x* C' r' ]; ?7 { 海洋无脊椎动物，预计基因组200+。
5 Q7 `8 M& g" [ k; z0 k' ^: r" e( {9 D
关于青岛华大基因研究院
' ?+ Z! D" r- e. w: ~' D5 Y 自2016年12月成立以来，青岛华大基因研究院致力于海洋生物资源研究的“存、读、懂、写、学、用”，在科研、产业等方面先后承担/参与了10项国家、省市级项目，主导/参与制定各级标准8项，截至2021年2月8日，已存取了87045份样本，开展了353个水生物种的测序工作，累积完成2017.7Tb测序数据产出。已与国内外164个科研院所开展了526个项目合作，在国内外著名期刊发表学术论文126篇（影响因子累计1114.22），申请专利21件，已授权11件，申请软著8件。已获批国家技术转移中心海洋生物专业领域分中心，山东省海洋生物多组学技术开发及应用工程技术研究中心，山东省新型研发机构等各项资质。 , T+ o5 T- f% k4 w' }6 K3 p: I
关于CNGBdb
+ Z5 @7 O; u$ o3 o1 o# j0 ]- @ 国家基因库生命大数据平台（CNGBdb）（ 了解详情）作为国内最大的生物大数据中心之一，汇集了国家基因库及全球其他重要数据源的公开数据，同时提供生命大数据可信计算平台等多种应用工具，致力于为科研工作者提供生物大数据共享和应用服务。 1 r- L2 }% C% b4 N! b* }
8 K0 l- A. ?8 B* t+ B& F: Q( G+ B j$ O; C& z( i9 Y) n0 V
' I8 v3 t8 r* k4 ]& `& C, n1 x g
( ^$ [8 ^! ?- {. B! q
| 
