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国外的不是那么熟悉，我只能提供基于中国本土的情况。
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你能够知道的、叫得上名字的大部分国际机基本都有开展海洋保护相关的项目，基于他们自己的策略，可能分别会从生态系统、关键物种或是气候等等变化角度入手来进行行动。但是由于中国是一个内陆为主的国家，所以我印象里只有保护国际CI和绿色和平在中国有开海洋项目；北京根与芽办公室也有做保护鲨鱼的项目。
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中国自己的本土组织，专门做海洋类型项目的，可能有：
蔚然大连
5 q7 z( U# X9 ]& M, N 上海仁渡
5 Y* [' [& g1 H7 p" Z' { 海南蓝丝带
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香港海洋保护协会
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- s# N7 s( p: A8 W" | 还有很多沿海的保护组织也会开展一些针对海洋的保护项目。
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