收藏本站 劰载中...网站公告 | 吾爱海洋论坛交流QQ群:835383472

xmitgcm下载LLC海洋模式数据

[复制链接]

上一节,我们介绍了xmitgcm的LLCreader入门操作,总体上这个工具可以通过网络自动加载门户网站(ECCO)的模式数据,实现对模式LLC4320(PB级)和LLC2160的读取。但还有许多问题尚未解决:
  • • 能否保存数据到本地
  • • 能否按照经纬范围选取数据
  • • 能否选择连续的一段时间(如70天,每小时一个)
  • • 能否做较复杂计算
    / k) ?, G2 q) w& t0 [
本节先介绍怎么通过LLCreader将数据下载本地,并使用GMT绘图。
+ d* O8 z, \) o, f5 ^
步骤加载llcreader$ J6 i6 v9 ]9 U+ W2 \
import xmitgcm.llcreader as llcreader
2 N( k: J. n8 z; L3 }( B) k
" {: {6 z% e9 ^: R* N  H3 V初始化模型
因为LLC4320数据体量较大,这里先以LLC2160为例。我们选择Theta进行导出测试。
model = llcreader.ECCOPortalLLC2160Model()* L0 Z8 @0 |6 D1 \

( c: x8 P# m2 @8 Tds_sst = model.get_dataset(varnames=['Theta'], k_levels=[0], type='latlon',/ }6 q/ |. f" |' n
                          iter_start=model.iter_start,
8 q/ E$ i% [9 [& U  w5 m: q# E2 E5 l                          iter_stop=(model.iter_start + model.iter_step),( T+ J+ ^# `  U- z% S7 G+ X  {
                          read_grid=True)# l) |1 G& {' e: t, `
ds_sst.Theta                          
e17c398cadb9e820fdac5f77c3133fe4.png
ds_sst的数据结构为Xarray的dataset,ds_sst.Theta的数据结构为Xarray的dataarray。可以看到Theta的数据大小是231M,这只是一个1小时快照的单层全球数据,体积不算太大。
58abfadff7631b95c513bd2043e38d04.png
# \* u/ }; N: o% z  u( h
上图为其coordinates,这是dataarray数据结构的一个关键术语,其中黑色粗体i,j,k,time表示维度坐标(Dimension coordinate),其他为无维度坐标(Non-dimension coordinate)。

& q$ P/ T: U% s9 M
绘图查看
% G+ c! f* ?; m+ ~+ q* D! R: h" Q  m0 @7 q
temp.Theta.plot()
f270b69e1b4897a0cd47fc89f200ecb6.png
维度坐标i,j作为其x和y轴,另一维度time和k(深度0)出现在标题上。
因为LLC为特殊的网格结构,这里暂时不能直接实现地理绘图。后面会对此进行单独介绍。

! B0 M( O2 R9 E2 c* D
保存 .to_netcdf()
) g9 N' w) x2 g
to_netcdf()是Xarray内置的函数,可将数据保存为nc格式。注意数据保存和llcreader函数无关,llcreader的主要作用是在线获得LLC模式数据,并转化成Xarray特有的数据结构,后面所有的操作都是使用Xarray,因此有必要对Xarray做全面的学习。后面会对此介绍。
ds_sst.Theta.to_netcdf('myfile.nc')
上述命令可以将Theta参数保存。通过panoply可以绘图展示SST参数的全球分布:
91cc1704eec295e82dba5dc4b4ea2558.png
删除不重要的坐标/ j( P8 ^4 a+ ~' j
但可以发现保存的文件大小是2.5G,远远超过了其自身大小,这是什么原因呢?
27bd7c12fcde88ccd1396cf073f4d373.png

* M* {2 S* @/ e& G原来是把无维度坐标全部保存了,这些坐标其实也是数据,因此占用很大空间。一共有11个这样的2D坐标,再加上Theta,数据体积就达到2.5G了。$ ^- ~- I, d( d$ A( N/ h- m
0 D  s7 E) j- A$ X+ Q' K
d403e8d05dabb82f32cb37999f6e03f8.png
这些无维度坐标可以删去:
ds_sst.Theta.reset_coords() # 将无维度坐标转为变量(不删除)( Q5 t( @6 v2 l) V+ z
ds_sst[["Theta"]].reset_coords(drop=True) # 将会删去无维度坐标
976ce67a006158504eefcf096d561940.png
若想保留某些坐标,比如经纬度XC,YC:
ds_sst.Theta.reset_coords()[["XC", "YC","Theta"]]
上面使用了[[ ]]做变量的筛选。
然后保存:
ds_sst[["Theta"]].reset_coords(drop=True).to_netcdf('myfile2.nc')
3 o/ Q& C7 r, _2 A0 dds_sst.Theta.reset_coords()[["XC", "YC","Theta"]].to_netcdf('myfile3.nc')
这样,数据体积就小了,其中myfile2.nc仅包含Theta,大小213M。
: b5 h; X" o  d0 Z" W
GMT绘图. J2 @7 i% q& W0 U0 ~  |/ ~
GMT绘图比ython自带函数更加强大,既然已经下载到本地,则看一下GMT绘图效果:
gmt begin ex02 png3 M( A% X# o$ _+ |9 ?* _% m9 A2 i
    gmt set MAP_ANNOT_OBLIQUE 0* K& z) \% Q0 c4 N4 [( ?/ i
    gmt subplot begin 2x1 -A+JTL -Fs16c/10c -M0 -R1000/2000/2500/3500 -JX15/13c -B100 -T"Aghulhas Rings"
) k2 u' g1 p! P# v        gmt subplot set 0,0 -Ce3c
8 S$ |  ]6 D1 F  T; j        gmt grd2cpt myfile3.nc?Theta -Cjet -Z
" g1 W7 W  P& z# G  ?+ U" y  B        gmt grdimage myfile3.nc?Theta -I+a90  
1 w5 g: C1 J; x% l! |1 s        gmt colorbar -DJRM+o1.5c/0+mc -I0.3 -Bx2+lTheta -By+ldegree
7 R0 R, {6 \; l- k1 v  b$ Y- ]7 G, v# @: W- q" ], p
        gmt subplot set 1,0 -Ce3c' s* _9 E0 I0 b3 n: \
        gmt grd2cpt myfile4.nc?Theta -Crainbow -Z& _2 I% B* {" g. S/ A$ F. q8 Z1 c1 ]
        gmt grdimage myfile4.nc?Theta; S4 n' f4 ]- q+ e# d9 A) M  w3 [
        gmt colorbar -DJRM+o1.5c/0+e+mc -Bx2+lTheta -By+ldegree0 |" j/ I8 S) L- m
    gmt subplot end+ P# O" S. D% Q. x
gmt end show 5 K4 q" e: r9 E  c
c8c573203e6afdb5b6b0dd2d6cb60576.png
台湾海域
1c9c67d88f9b8f004fc59c26c772f279.png
下节预告
  • • 范围的筛选
  • • 时间维度的连续导出; ?1 Q3 l, B" R$ F- c; Y

: I% I) v# @3 v5 W9 y' b2 d5 Y! P
回复

举报 使用道具

相关帖子

全部回帖
暂无回帖,快来参与回复吧
懒得打字?点击右侧快捷回复 【吾爱海洋论坛发文有奖】
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册
半座山
活跃在2026-4-4
快速回复 返回顶部 返回列表