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一公升的海水不仅可以揭示最近几十种鱼类的存在,还可以揭示这些鱼类的相对数量。 6 c5 x- F8 L0 x, l4 t
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根据最广泛的同类比较,从新泽西州海岸采集的海水样本中发现的不同物种DNA的相对丰度与更昂贵和破坏性更强的底拖网捕捞技术收集的数据有很好的相关性。
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- Q& s. m) @: N, f% t6 `7 P 纽约市洛克菲勒大学环境遗传学研究员马克·斯托克尔说:“这对海洋科学来说真的是一个游戏规则的改变,有很多应用。”。他补充说,随着DNA分析变得更便宜、更准确,环境DNA分析可以应用于任何领域,从跟踪捕鱼作业引起的鱼类种群波动,到对气候变化对物种多样性和丰度的影响进行编目。
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斯托克尔的团队分析了新泽西州环境保护部(New Jersey Department of Environmental Protection)进行的多种拖网捕捞,以确定鱼类的物种多样性和丰度。他们还要求技术人员从2019年1月至11月每月从拖网作业的海面和海底采集多个1升装的水样。 6 h9 @; F3 f, h1 \
1 @7 p3 z) _8 C1 {- u' m 他们的环境DNA分析发表在ICES海洋科学杂志上,揭示了存在哪些鱼类物种,以及每个物种的DNA拷贝数。鱼类的丰度和物种多样性与拖网调查结果有70%的相关。 1 Z; b6 O4 |% _
他们还研究了这些数字在季节中的变化。这一点很重要,因为研究人员认为有些DNA可能会在环境中停留更长时间,因此eDNA(在环境样品中所有被发现的不同生物的基因组DNA的混合)数据可能会呈现给定时间鱼类种群的扭曲快照。但斯托克尔的团队发现,eDNA和鱼类拖网调查的相关性也很好。
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5 F+ g+ J3 `9 ]+ l4 B4 o eDNA
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8 u, N8 ^9 s- w. y Q, ~# g8 k% N 先前的研究人员还担心,一个单独个体不久前穿过该区域的一大块组织可能会过度代表物种的存在。同样的,一群鱼也可以在没有留下那么多DNA的情况下通过。
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1 A; ~! n4 ~* S* y8 o |& T 新泽西州蒙茅斯大学的海洋科学家、这项研究的合著者杰森·阿道夫说,底拖网并不能提供一幅完美的鱼类种群图,因为鱼网可能会直接经过大鱼群而没有捕捉到它们。环境DNA也不是100%准确,但它比底拖网便宜,而且DNA分析一直在改进。
- p5 A @1 y& Z3 U “这是一种看待海洋生物的全新方式,”斯托克尔说,“我们才刚刚开始利用它。” 8 J& [) g: E* L5 g# Z
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