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4 T: K6 w m- m 文图/寇琦 李新正 ! Z7 e+ O3 Q' }: c! R B G* ~
中国科学院海洋研究所 / U$ a% Z: G5 j5 u7 E+ H; `6 E
本文节选自《知识就是力量》杂志
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我们知道,绝大多数的生物都是以DNA作为遗传物质的,并且不同种的生物之间,它们所具有的DNA序列也是不一样的。凭借这个特性,生物学家们设想:能不能借助DNA序列来对生物进行鉴定呢? ) s2 r; @/ B+ y
进入21世纪,伴随着DNA测序技术的快速发展、计算机及互联网的普及,这一想法成为了现实。这,就是我们今天要跟小伙伴们介绍的DNA条形码技术。
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# F$ n L6 n6 m& @" Z6 S 海洋生物DNA条形码技术
% q P. O9 a7 |: i; d DNA条形码技术与超市利用条形码扫描,区分成千上万种不同的商品十分类似,就是利用一段标准DNA序列作为标记,以实现快速、准确和自动化物种鉴定的技术。
: O0 b4 `$ g4 d$ y1 P: M 海洋生物DNA条形码技术是以各种海洋生物为研究对象,在具体操作过程中,它包括两个方面,一是海洋生物DNA条形码数据库的构建,二是海洋生物DNA条形码数据库的访问和使用,这二者是相互对应、相互促进的。前者是技术的基础,它为使用者们提供了大量数据与资料,作为一个资源整合与共享的平台而存在;后者是对该技术的应用,它在帮助使用者们解决一系列与海洋生物鉴定相关的问题的同时,也促进了建设者们对数据库的不断完善。 % Q2 { I" c- _; v3 q+ \6 f
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海洋浮游生物标本库 3 Q5 [3 C: K7 A6 `7 W
科学家如何挑选DNA序列?
/ @! X. [! }* y 适合作为“条形码”的DNA序列,科学家们是如何选中的呢? 7 {3 {3 T5 m. M( L5 Y, a: W& G
通常来说,能做“条形码”的DNA片段,要求长度较短、易于扩增、变异率适度(种间遗传距离明显大于种内遗传距离,以形成相应的条形码间隔)。此外,该目标片段还应当具有足够的数据库信息,以便在获得DNA序列后,得以进行序列比对和人工校正。 & N) _; z) u$ w$ |8 Y
科学家们通过构建简易的进化树,并计算样本DNA序列的遗传距离,就能判断未知样品与数据库中已知种类的关系了。
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( _6 L" i$ f( u1 u( u& ~ 海洋生物DNA条形码技术已经在众多领域崭露头角,我们相信,随着相关技术的不断完善和革新,未来海洋生物DNA条形码技术一定有更加广阔的应用前景。 " A9 H2 G g. C, e% s
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